MultiGeneBlast

Təsvir

MultiGeneBlast, NCBI GenBank zülal girişlərinin FASTA başlıqlarının yenidən formatlaşdırılmasına əsaslanan açıq mənbə alətidir və ondan istifadə edərək onların mənbə nukleotidlərini və koordinatlarını izləyə bilir. MultiGeneBlast sintetik biologiya layihələri üçün belə multigen hissələrin aşkarlanmasına kömək edə bilər. Funksiyaları istifadəçinin istədiyinə ən yaxın olan operonları müəyyən etmək üçün onun çıxışı əsasında operonların sintetik kitabxanası yaradıla bilər. Bu alət hər bir gen üzrə tək BlastP əməliyyatlarının nəticələrini birləşdirərək və hər hansı GenBank girişindən genomik bölgələri hitlərin sayına, sinteniyanın qorunmasına və məcmu Partlayış bitinə görə çeşidləməklə bütün homoloji genomik bölgələri müəyyən etmək imkanlarını təmin edir. Arxitektura axtarışları istifadəçi tərəfindən müəyyən edilmiş amin turşusu ardıcıllığının istənilən kombinasiyasına Blast hitləri olan istənilən genomik bölgələri tapmaq üçün həyata keçirilə bilər.